Химические реакции компьютерного синтеза. Списки целей компьютерного синтеза

Значительные количества стратегий дает возможность удовлетворить любые запросы оператора, однако делает процесс длительным. Для решения этой проблемы в каждой библиотеке трансформаций всем структурным фрагментам присваивают соответствующие рейтинги. Наиболее высокие показатели имеют структурные фрагменты, при образовании которых осуществляется одновременное замыкание наибольшего числа связей (реакции Симмонса—Смитта, Дильса—Альдера).

Что касается химических превращений, то в каждом разделе библиотек они расположены в порядке уменьшения приоритетности синтетических реакций. Наивысший рейтинг имеют реакции введения функциональных групп; затем следуют реакции построения молекулярного скелета, реакции изомеризации, реакции введения защиты, удаления защиты функциональных групп. Реакции фрагментации имеют самый низкий рейтинг, поскольку такие трансформации усложняют структуру заданной ХС.
Окончательная оценка (рейтинг) трансформации определяется в результате выполнения ряда тестов, содержащихся в самом описании трансформации.

В некоторых случаях кроме тестов используются так называемые «списки целей», которые содержат указания о требуемых изменениях скелета и функциональных групп. Параллельно с этим, происходит отбраковка превращений из библиотек трансформаций если их тип не соответствует ни одной из целей, перечисленных в списке.

компьютерный синтез

Формальная корректность генерированных структур в некоторых программах ретро-синтетического направления определяется дополнительными критериями, среди которых основное место занимают специальные банки данных (каталоги) доступных соединений.

Следовательно, в решении задач планирование синтеза биологически активных веществ, прогнозирование направления реакций значительную роль играет КС. Использование такого методического подхода значительно упрощает реальный синтез, создает предпосылки для разработки высокопродуктивных технологий.

В рамках комбинаторного анализа, на базе которого построены принципы конструирования лекарств, виртуального скрининга, компьютерного синтеза, а в некоторых случаях и изучения механизмов реакций составлены банки данных и библиотеки.

Комбинаторная химия, предметом которой является использование комбинаторных процессов для получения (синтеза) определенных рядов соединений из наборов строительных блоков, также пользуется библиотеками. Однако они относятся к так называемым синтетическим и представляют собой своего рода коллекции (наборы).

- Читать далее "Синтетические библиотеки в фармации. Комбинаторные библиотеки и химия"

Оглавление темы "Синтез и его моделирование в фармакологии":
1. Метод Gene Calling. Микрочипы в фармакологии
2. Высокопродуктивные технологии БАВ. Компьютерный синтез в фармакологии
3. Виды компьютерного синтеза. Стадии поиска компьютерного синтеза
4. Химические реакции компьютерного синтеза. Списки целей компьютерного синтеза
5. Синтетические библиотеки в фармации. Комбинаторные библиотеки и химия
6. Метод реакционной смеси. Реакционные блоки
7. Синтез смесевых комбинаторных библиотек. Вариативность метода синтеза
8. Параллельный синтез. Библиотеки смесей
9. Исследования веществ комбинаторных библиотек. Вещества с В- и Т-клеточной специфичностью
10. Библиотека из библиотеки. Автоматизация синтетических процессов

Ждем ваших вопросов и рекомендаций: